两个称呼指的是同一所学校吗
是同一所学校。东京科学大学是这所学校的中文正式名称，Science Tokyo 是它的英文缩写，对应的英文全称是 Institute of Science Tokyo。你在中文材料里看到"东京科学大学"，在英文材料里看到"Science Tokyo"或"Institute of Science Tokyo"，指的都是同一所日本国立大学，只是语言和写法不同，并不是两所学校，也不是一所学校的两个分支。
中文名：东京科学大学
这所学校的中文正式名称是"东京科学大学"。在中文环境下查资料、填表格、写申请材料时，建议直接使用"东京科学大学"这四个字，不要自行简写成"东京科大""东科大"之类的称呼——这些都不是官方或广泛使用的别名，写进正式材料反而可能让审核方对不上号。
根据已知信息，这所学校目前没有其他广泛使用的其他中文别名或俗称。也就是说，除了"东京科学大学"之外，没有第二个需要你特别记住或防备的常用中文叫法。
英文缩写：Science Tokyo
英文场景下，这所学校的全称是 Institute of Science Tokyo，日常和官方材料里常缩写成 Science Tokyo。你在英文官网、英文申请系统、英文邮件往来中，大概率会同时遇到全称和这个缩写，二者指向一致，不用纠结哪个更"对"。
需要留意的是：缩写是 Science Tokyo，不是 "Tokyo Science"，也不是其他词序。填表时如果系统要求填学校英文名，优先照着对方给的格式填全称 Institute of Science Tokyo，缩写只用在非正式沟通里。
容易和哪些旧校名混淆
这是查这所学校时最容易踩的坑。东京科学大学是 2024 年由东京工业大学（Tokyo Tech）与东京医科齿科大学（TMDU）合并新设的，中文译名"东京科学大学"是新名字。不少旧资料、旧排名、旧论坛帖子仍然沿用或对照旧校名"东京工业大学"，所以你搜资料时很可能同时撞见"东京科学大学"和"东京工业大学"两种写法。
要分清：东京工业大学是合并前的旧校名，东京科学大学是合并后的新校名；在当下（2024 年合并之后）的正式语境里，应以"东京科学大学"为准。如果你的材料里出现了"东京工业大学"，需要判断它指的是合并前的旧校，还是别人沿用了旧称来指现在的这所学校。
查资料和填表时要注意什么
第一，确认年份和语境。2024 年之前发布的留学攻略、排名、经验帖，多数用的是旧校名，引用时别直接当成现在的官方名称。
第二，填表统一口径。签证申请、学校申请、资金证明等正式表格里，中文用"东京科学大学"，英文用"Institute of Science Tokyo"（或对方指定缩写 Science Tokyo），前后保持一致，不要一篇材料里混用新旧校名。
第三，看到不确定的叫法先核实。除了上面提到的名字，如果资料里冒出其他中文别名或奇怪缩写，不要默认它指这所学校，回到学校官网当年发布的信息核对。
具体项目信息以学校官网当年发布为准。